學校堅持統籌規劃、突出重點、開放共享的原則，加大對省（市）重點實驗室、工程技術研究中心、工程實驗室等科研平臺經費投入，建設（市）級科研平臺34個，其中省級13個（企業與學校共建4個），市級25個。另外，已合作共建鄭州大學南陽研究院和南陽市大數據研究院。
省級科研平臺建設情況統計表
| 序號 | 科研平臺名稱 | 認定（組建）部門（時間） | 依托學院 | 負責人 |
| 1 | 河南省張仲景方藥與免疫調節重點實驗室 | 河南省科技廳（2017） | 張仲景國醫國藥學院 | 卞華 |
| 2 | 河南省工業微生物資源與發酵技術重點實驗室 | 河南省科技廳（2017） | 生物與化學工程學院 | 郭書賢 |
| 3 | 信息感知與機器人應用技術河南省工程實驗室 | 河南省發改委（2017） | 信息工程學院 | 喬建良 |
| 4 | 張仲景方藥大數據產業技術研究院（河南大數據科技研究院） | 河南省發改委（2017） | 計算機與軟件學院 | |
| 5 | 云計算虛擬化技術河南省工程實驗室 | 河南省發改委（2015） | 計算機與軟件學院 | 王耀寬 |
| 6 | 移動終端自適應處理技術河南省工程實驗室 | 河南省發改委（2012） | 計算機與軟件學院 | 段云濤 |
| 7 | 河南省制造業信息化技術服務中心 | 河南省科技廳（2003） | 智能制造學院 | 王林鴻 |
| 8 | 河南省水資源與生態環境保護院士工作站 | 河南省科技廳（2011） | 土木工程學院 | 張銦 |
| 9 | 河南省黃酒工程技術研究中心（鄧州市光照酒業有限公司） | 河南省科技廳（2017） | 生物與化學工程學院 | |
| 10 | 河南省工坊啤酒工程技術研究中心（南陽市京德啤酒技術開發有限公司） | 河南省科技廳（2018） | 生物與化學工程學院 | |
| 11 | 河南省電機振動與噪聲工程技術研究中心 | 河南省科技廳（2018） | 智能制造學院 | 王林鴻 |
| 12 | 河南省鎂、鋁合金成型及檢測工程技術研究中心（河南匯森機械設備鑄造有限公司） | 河南省科技廳（2018） | 智能制造學院 | |
| 13 | 河南省智能物聯及安全技術工程研究中心 | 河南省發改委（2019） | 數字媒體與藝術設計學院 | 薛慶吉 |
市級科研平臺建設情況統計表
| 序號 | 科研平臺名稱 | 認定（組建）部門（時間） | 依托學院 | 負責人 |
| 1 | 南陽市人居環境生態與節能重點實驗室 | 南陽市科技局（2018） | 建筑學院 | 張建文 |
| 2 | 南陽市自主可控安全技術重點實驗室 | 南陽市科技局（2018） | 計算機與軟件學院 | 李亞紅 |
| 3 | 南陽市通信信號處理工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2018） | 信息工程學院 | 路新華 |
| 4 | 南陽市工業微生物菌種保藏工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2017） | 生物與化學工程學院 | 郭書賢 |
| 5 | 南陽市基因測序與功能分析技術研究中心 | 南陽市科技局（2017） | 生物與化學工程學院 | 陳平 |
| 6 | 南陽市催化功能材料重點實驗室 | 南陽市科技局 （2017） | 生物與化學工程學院 | 杜朝軍 |
| 7 | 南陽市電機減振降噪重點實驗室 | 南陽市科技局（2016） | 機械與汽車工程學院 | 蔡廣宇 |
| 8 | 南陽市中醫免疫學重點實驗室 | 南陽市科技局（2016） | 張仲景國醫國藥學院 | 卞華 |
| 9 | 南陽市土木工程性能檢測重點實驗室 | 南陽市科技局（2016） | 土木工程學院 | 陳孝珍 |
| 10 | 南陽市裝配式建筑工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2016） | 土木工程學院 | 陳孝珍 |
| 11 | 南陽市功能食品工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2016） | 張仲景國醫國藥學院 | 岳春 |
| 12 | 南陽市水處理與循環利用工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2016） | 生物與化學工程學院 | 李入林 |
| 13 | 南陽市精釀啤酒工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2016） | 生物與化學工程學院 | 李慧星 |
| 14 | 電機振動與噪聲河南省高校工程技術研究中心 | 河南省教育廳（2015） | 智能制造學院 | 王林鴻 |
| 15 | 南陽市自動化與智能控制系統重點實驗室 | 南陽市科技局（2012） | 智能制造學院 | 高有堂 |
| 16 | 南陽市數字媒體技術重點實驗室 | 南陽市科技局（2011） | 數字媒體與藝術設計學院 | 朱巍 |
| 17 | 南陽市軟件工程重點實驗室 | 南陽市科技局（2009） | 計算機與軟件學院 | 劉黎明 |
| 18 | 南陽市工業微生物重點實驗室 | 南陽市科技局（2009） | 生物與化學工程學院 | 薛剛 |
| 19 | 南陽市先進制造技術重點實驗室 | 南陽市科技局（2008） | 智能制造學院 | 王林鴻 |
| 20 | 南陽市張仲景方藥研究重點實驗室 | 南陽市科技局（2008） | 張仲景國醫國藥學院 | 卞華 |
| 21 | 南陽理工學院電子商務協同創新中心 | 河南省教育廳（2019） | 范蠡商學院 | 郭永奇 |
| 22 | 南陽市移動安全重點實驗室 | 南陽市科技局（2019） | 計算機與軟件學院 | 林玉香 |
| 23 | 南陽市生物化工產品分析與檢測技術重點實驗室 | 南陽市科技局（2019） | 生物與化學工程學院 | 朱元良 |
| 24 | 南陽市植物抗氧化成分提取工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2019） | 生物與化學工程學院 | 薛剛 |
| 25 | 南陽市道地藥材品質評價與利用工程技術研究中心 | 南陽市科技局（2019） | 張仲景國醫國藥學院 | 黃顯章 |
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